Formar Maestros en Ciencias en Ingeniería de Sistemas con una visión sistémica transdisciplinaria a través de un plan de estudios innovador y pertinente en las Líneas de Generación y Aplicación del Conocimiento en áreas de Sistemas Complejos, Sistemas de Ingeniería y Sistemas de Información y Comunicación, mediante investigación científica y tecnológica para resolver Problemas Nacionales Estratégicos (PRONACES) y contribuir al desarrollo tecnológico, económico, político y social del país con calidad, responsabilidad, ética, tolerancia y compromiso social.
Ser referente de la oferta educativa del Instituto Politécnico Nacional en los ámbitos nacional e internacional en el nivel de Maestría por la calidad en la formación de docentes e investigadores con una visión sistémica transdisciplinaria, capaces de resolver Problemas Nacionales Estratégicos con productos innovadores para dar respuesta integral, crítica y propositiva a los difíciles retos y transformación del país.
El programa de Maestría en Ciencias en Ingeniería de Sistemas tiene por objetivo formar recursos humanos de alto nivel científico-técnico con visión sistémica-transdisciplinaria para realizar investigación, docencia y dirección de actividades profesionales acorde con las necesidades del sector productivo primario, secundario y terciario del país en beneficio de la sociedad y el desarrollo del país.
La Maestría en Ciencias en Ingeniería de Sistemas con orientación en investigación forma maestros de alto nivel científico-técnico con visión sistémica transdisciplinaria para realizar investigación, docencia y dirección de actividades profesionales acorde con las necesidades del sector productivo primario, secundario y terciario del país en beneficio de la sociedad y el desarrollo del paísporque a través de su Plan de Estudios ofrece al estudiante una formación integral; toda vez, que el egresado cuenta con las competencias, conocimientos, actitudes y valores que le permitan resolver problemas en su entorno laboral con un enfoque sistémico transdisciplinario en el sector primario (agricultura e industria extractiva), secundario (manufactura) y terciario (prestación de servicios educativos, turismo y comercio).